Ранее предлагались способы восстановить связи по сохранившемуся в контрагентах реквизиту «Основное контактное лицо». Но если у контрагента было несколько контактов, то этот способ вернет вам только одного.
Выкладываю обработку, которая возвращает ранее имеющиеся связи (формирует записи в регистре сведений) на основании копии ИБ, которую вы делали перед обновлением.
В обработке необходимо указать путь до архивной копии, логин и пароль пользователя, имеющего право на чтение справочника "Контрагенты" и "Контактные лица". Архив должен храниться в файловом варианте.
Подключение к архиву происходит через COM-соединение, поэтому если у вас появляется ошибка — необходимо зарегистрировать библиотеку comcntr.dll (находится в каталоге с установленной платформой в папке bin).
Данную обработку также можно запускать на конфигурациях, написанных на основании УНФ (например, "1С:Предприятие 8. Автосервис").