При переходе с Бухгалтерии 1.6 на Бухгалтерию 2.0 все перенесённые документы не проводятся, эта обработка проводит все документы, независимо от того, были они проведены до начала или не были.
Обработка — копия встроенной в Бухгалтерию 2.0 обработки группового перепроведения, только вместо условия «проведён» она отбирает по условию «не помечен на удаление».
Я её использую после исправления ввода начальных остатков для проведения кучи непроведённых документов.
Конечно же, перед использованием настоятельно рекомендую сделать резервную копию базы.